MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 34090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	384892009
2	NC_017358	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	384892009
3	NC_017358	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892009
4	NC_017358	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	384892009
5	NC_017358	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892009
6	NC_017358	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	384892009
7	NC_017358	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	384892009
8	NC_017358	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892009
9	NC_017358	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892009
10	NC_017358	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892009
11	NC_017358	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	384892009
12	NC_017358	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892010
13	NC_017358	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	384892010
14	NC_017358	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892010
15	NC_017358	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892010
16	NC_017358	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	384892010
17	NC_017358	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892010
18	NC_017358	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	384892010
19	NC_017358	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892010
20	NC_017358	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	384892011
21	NC_017358	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892011
22	NC_017358	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892011
23	NC_017358	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384892011
24	NC_017358	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892011
25	NC_017358	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384892011
26	NC_017358	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	384892011
27	NC_017358	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	384892011
28	NC_017358	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892011
29	NC_017358	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	384892011
30	NC_017358	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	384892011
31	NC_017358	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892011
32	NC_017358	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384892011
33	NC_017358	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	384892011
34	NC_017358	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	384892011
35	NC_017358	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	384892011
36	NC_017358	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892011
37	NC_017358	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892011
38	NC_017358	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892011
39	NC_017358	T	6	6	1717	1722	0 %	100 %	0 %	0 %	384892011
40	NC_017358	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892012
41	NC_017358	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	384892012
42	NC_017358	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384892012
43	NC_017358	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	384892012
44	NC_017358	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892012
45	NC_017358	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	384892012
46	NC_017358	ACT	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892012
47	NC_017358	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	384892012
48	NC_017358	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892012
49	NC_017358	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	384892012
50	NC_017358	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892012
51	NC_017358	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892012
52	NC_017358	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892012
53	NC_017358	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	384892012
54	NC_017358	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892012
55	NC_017358	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892012
56	NC_017358	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384892012
57	NC_017358	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	384892012
58	NC_017358	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	384892012
59	NC_017358	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017358	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	384892013
61	NC_017358	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	384892013
62	NC_017358	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	384892013
63	NC_017358	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	384892013
64	NC_017358	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384892013
65	NC_017358	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	384892013
66	NC_017358	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	384892013
67	NC_017358	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	384892013
68	NC_017358	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892013
69	NC_017358	T	6	6	3020	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	384892013
70	NC_017358	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892013
71	NC_017358	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892013
72	NC_017358	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384892013
73	NC_017358	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	384892014
74	NC_017358	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	384892014
75	NC_017358	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	384892014
76	NC_017358	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892014
77	NC_017358	TTG	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892014
78	NC_017358	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892014
79	NC_017358	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	384892014
80	NC_017358	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	384892014
81	NC_017358	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892014
82	NC_017358	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384892014
83	NC_017358	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017358	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017358	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017358	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017358	TGG	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017358	GTG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017358	ACC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017358	GGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017358	ACG	2	6	4490	4495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017358	A	7	7	4580	4586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017358	T	8	8	4600	4607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017358	AAT	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017358	GAAAC	2	10	4650	4659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017358	TAAA	2	8	4690	4697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017358	TGT	2	6	4749	4754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892015
98	NC_017358	CA	3	6	4908	4913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017358	G	6	6	4969	4974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017358	TAC	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017358	A	6	6	5045	5050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017358	A	7	7	5116	5122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017358	A	6	6	5217	5222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017358	TAAAA	2	10	5252	5261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017358	ATAAA	2	10	5271	5280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017358	T	6	6	5282	5287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017358	TTA	2	6	5328	5333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017358	CAAA	2	8	5391	5398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017358	TCA	2	6	5419	5424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017358	CAT	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
111	NC_017358	GCC	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384892016
112	NC_017358	TCT	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
113	NC_017358	AAT	2	6	5609	5614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892016
114	NC_017358	CTT	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
115	NC_017358	TTCA	2	8	5687	5694	25 %	50 %	0 %	25 %	384892016
116	NC_017358	CAT	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
117	NC_017358	GC	3	6	5754	5759	0 %	0 %	50 %	50 %	384892016
118	NC_017358	ATG	2	6	5760	5765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892016
119	NC_017358	TCA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
120	NC_017358	CCA	2	6	5841	5846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892016
121	NC_017358	CTT	2	6	5857	5862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
122	NC_017358	TCA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
123	NC_017358	T	6	6	5906	5911	0 %	100 %	0 %	0 %	384892016
124	NC_017358	AG	3	6	5966	5971	50 %	0 %	50 %	0 %	384892016
125	NC_017358	TCTT	2	8	5981	5988	0 %	75 %	0 %	25 %	384892016
126	NC_017358	TTG	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892016
127	NC_017358	CAT	2	6	6061	6066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
128	NC_017358	GTG	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892016
129	NC_017358	TTC	2	6	6173	6178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
130	NC_017358	TAA	2	6	6181	6186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892016
131	NC_017358	CCG	2	6	6192	6197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384892016
132	NC_017358	TCT	2	6	6230	6235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
133	NC_017358	CAC	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892016
134	NC_017358	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892016
135	NC_017358	T	6	6	6367	6372	0 %	100 %	0 %	0 %	384892016
136	NC_017358	TAG	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892016
137	NC_017358	T	7	7	6406	6412	0 %	100 %	0 %	0 %	384892016
138	NC_017358	CTT	2	6	6547	6552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
139	NC_017358	TCT	2	6	6657	6662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
140	NC_017358	T	6	6	6674	6679	0 %	100 %	0 %	0 %	384892016
141	NC_017358	T	6	6	6686	6691	0 %	100 %	0 %	0 %	384892016
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411	NC_017358	A	7	7	20346	20352	100 %	0 %	0 %	0 %	384892028
412	NC_017358	A	6	6	20368	20373	100 %	0 %	0 %	0 %	384892028
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